局合理、協調發展的學科專業體系。現開設12個學科門類的99個本科專業。有8個一級學科博士學位授權點、64個二級學科博士學位授權點，40個一級學科碩士學位授權點、242個二級學科碩士學位授權點，5個博士后科研流動站。具有1種一級學科博士專業學位授予權、15種碩士專業學位及在職人員以同等學歷申請碩士學位授予權。有國家重點實驗室1個，國家工程技術研究中心1個，國家重點學科2個，教育部重點實驗室2個，教育部工程中心2個，教育部人文社會科學重點研究基地1個，教育部創新團隊2個，國家級臨床藥理基地1個，國家臨床重點專科1個，國家干細胞工程技術研究中心江西分中心1個。有國家級實驗教學示范中心3個、特色專業9個、教學團隊1個、精品課程2門、雙語教學示范課程1門，有江西省高水平重點學科5個，江西省重點學科41個。
"十一五"期間，學校科研經費總額達9.076億元，承擔國家和省部級科研項目1419項，專利授權217項，分別比"十五"期間增長343%、217%和578%，呈現快速增長態勢。發表SCI收錄論文1030篇，EI收錄論文706篇，ISTP收錄論文443篇，CSSCI收錄論文1045篇。取得了硅襯底GaN基藍光LED技術、純電動汽車等一批重大標志性成果，涌現了一批具有突出貢獻的科技專家，帶動并促進了學校自主創新能力的顯著提升，科技成果轉讓帶動政府、社會總投資37.2億元。在組建國家級重點實驗室、承擔國家級重大課題研究方面取得突破并呈現良好增長勢頭。
多年來，學校以科教興贛為己任，推進學研產用相結合，促進科研成果向現實生產力轉化。先后與省內外地方政府、行業、企業單位簽訂一批全面合作協議，涌現出中興軟件（南昌）公司等一批產業基地。依托學校硅襯底GaN基藍光LED技術組建的晶能光電（江西）有限公司，突破了日、美少數公司的壟斷，在世界形成了藍寶石、碳化硅、硅襯底半導體照明技術方案三足鼎立的局面，其新型半導體綠色照明產品已廣泛應用于路橋及大型建筑照明。高速鐵路軌道狀態數字化檢測技術為中國高鐵實現跨越式發展做出了突出貢獻。助推江西社會發展的智囊團、思想庫作用日益顯現。南昌大學科技園為國家大學科技園，是首家"國家專利技術展示交易中