上海交通大學醫學院（Shanghai Jiao Tong University School of Medicine）由中華人民共和國教育部、中華人民共和國衛生部和上海市人民政府共建，位列“211工程”、“985工程”、“雙一流”，入選中國首批“卓越醫生教育培養計劃”，是國家級臨床技能實驗示范中心學科組長單位。

上海交通大學醫學院前身是由圣約翰大學醫學院、震旦大學醫學院、同德醫學院于1952年全國高等學校院系調整時合并而成的上海第二醫學院；1985年，更名為上海第二醫科大學。1997年，學校通過了“211工程”立項。2005年7月18日，上海交通大學與上海第二醫科大學合并，成立了由教育部、上海市人民政府重點共建的上海交通大學醫學院，進入“985”高校行列。2010年11月，學院成為衛生部與教育部合作共建的第一批十個重點高校中的一員。

截至2013年12月底，學院擁有重慶南路、閔行、南匯三個校區，下設23個學院（系）、14所附屬醫院、1所衛生學校，開辦10個本科專業（方向）；有教職醫務員工22707名，專任教師634名；有在校學生6828名，其中本科及長學制學生2723名，研究生3842名，留學生263名。

• 上海交通大學醫學院

2005年，上海交通大學、上海第二醫科大學正式合并。新的上海交通大學為教育部直屬高校，在原上海第二醫科大學和原上海交通大學醫學院基礎上，組建上海交通大學醫學院。教育部和上海市政府將合作共建上海交通大學醫學院。同年，醫學教育發展與研究中心、二醫大生命醫學倫理中心成立揭牌成立。附屬寶鋼醫院改名為附屬第三人民醫院。上海市教委批準原上海第二醫科大學衛生技術學院為獨立設置的全日制高等學院?上海衛生職業技術學院，由上海市教委與上海交通大學醫學院雙重領導。6月，醫學教育發展與研究中心對二醫大二級學院及相關部處開展自2003年教學評估以來首次教育教學整改驗收工作，驗收采取發展性教學評價，對學校各方面所采取的措施及成效等內容進行驗收。

2006年，醫學院“十五”、“211工程”建設項目接受并通過專家組評審驗收。同年，上海交大醫學院數字醫學研究院成立。上海交通大學人文與衛生管理學院（上海交通大學國藥人文與衛生管理學院）更名為上海交通大學公共衛生學院。上海市精神衛生中心、中國福利會國際和平婦幼保健院正式成為上海交大醫學院附屬醫院。

2007年，醫學院婦產科學研究所、上海交通大學醫學院上海干細胞研究所、醫學院精神衛生學系、婦產科學系、兒科學系分別成立。上海交通大學醫學院蘇州九龍醫院開業。醫學院中法醫學部、上海交通大學醫學科學研究院分別舉行揭牌儀式。

2008年，上海國際造口治療師學校在醫學院附屬第九人民醫院揭牌成立。本年度首次在學生中嘗試中國國內外聯合培養“MD+PhD”雙學位研究生。

2015年，上海交通大學醫學院附屬衛生學校和上海市衛生學校合并組建成立上海健康醫學院附屬衛生學校。