南通共有3所本科大學，名單分別為南通大學、南通理工學院、南通大學杏林學院，其中南通大學是一所涵蓋經濟學、文學、理學、工學、醫學、管理學和藝術學等七大學科門類。，具體完整本科大學名單見下表。

南通本科院校名單一覽表

南通大學簡介

學校設有20個學院、1個獨立學院（杏林學院）、1家直屬大型綜合三級甲等醫院（南通大學附屬醫院）和國際教育學院、繼續教育學院。擁有基礎醫學、臨床醫學2個博士后流動站，基礎醫學、臨床醫學、信息與通信工程3個一級學科博士點，22個一級學科碩士點，10個碩士專業學位點。臨床醫學、神經科學與行為學、工程學等3個學科進入ESI學科全球排名前1%。擁有江蘇省高校優勢學科2個、江蘇省重點學科8個、江蘇省臨床醫學重點專科24個。

學校現有教職工3154人，其中高級職稱以上1568人，博士、碩士生導師1379人。共有兩院院士9人（含雙聘院士8人），國家教學名師1人，國家“”專家2人，國家杰出青年科學基金獲得者2人，國家優秀青年科學基金獲得者1人，“百千萬人才工程”國家級人選3人，中科院“”入選者2人，“973”項目首席科學家1人，國家重點研發計劃項目首席科學家4人，教育部新世紀人才5人，奧運會冠軍1人，江蘇省“333”高層次人才第一層次1人、第二層次10人，江蘇省特聘教授15人，江蘇省“雙創”人才6人。