嚴格按照國家有關規定收費，遵循屬地原則，具體收費標準按照云南省物價局和楚雄州物價局核定的標準執行，即學費5000元/生/年，住宿費400至1200元/生/年。

楚雄醫藥高等專科學校是楚雄彝族自治州人民政府主辦、省州共管的高等專科學校。學校堅持“以人為本，重質量、突特色、創品牌”的辦學理念。實施“藥學、檢驗特色骨干專業支撐學校發展”戰略，秉承“勵志篤行，大醫精誠”的校訓，弘揚“遠志勤業，厚德濟世”的校風，堅持“博學善導，敬業求真”的教風，倡導“虛心好學，善思勤勉”的學風。建校60年來為云南省培養各類醫療衛生技術人才近2萬人。
學校現有教職工251人，其中專任教師199人，教授9人，副教授55人，講師65人，雙師型教師75人，省級教學名師1人，校級教學名師4人。學校面向全國十六個省市招生，現有全日制在校專科學生4579人。
學校設有檢驗系、藥學系、醫學系、基礎醫學系、公共部和思想政治理論課部等6個系（部）和1個藥物研究所，開設有醫學檢驗技術、藥學、護理、臨床醫學、中藥、衛生檢驗與檢疫技術、醫學生物技術、公共衛生管理、藥物分析技術、藥品經營與管理、醫學檢驗技術（病理檢驗技術方向）、醫學檢驗技術（輸血技術方向）、康復治療技術、醫療保險實務、醫學文秘等15個專業和專業方向。2013年申報了口腔醫學、醫學影像技術、口腔醫學技術等專業，迎接省教育廳和教育部的評估。建有中央財政支持的實訓基地1個，中央財政支持提升專業服務產業能力建設項目1個，省財政支持提升專業服務產業能力建設項目1個，省級示范實習實訓基地7個，省級特色專業建設點2個，省級教學團隊2個，省級精品課程1門，省級高等學校優秀教材4門，省級“十二五”規劃教材5門。校外實習實訓基地133個。
學校坐落于擁有“人類發祥地”和“古生物寶庫”之美譽的滇中腹地??楚雄；交通便利，校園環境優美，學校辦學條件優良，總占地面積452.6畝，校舍建筑面積88826平方米，標準實驗室58個、多媒體教室65個，擁有完備的校園網絡體系。教學科研儀器設備總值2306萬元，館藏圖書26萬冊。學校先后獲“全國民族團結進步先進集體”、“云南省文明單位”、“云南省文明學校”、“云南省職業教育先進集體”、“云南省德育工作先進集體”、“云南省廉政文化示范學校”等榮譽和稱號。2010年，學校順利通過了人才培養工作評估。
學校的工作思路和主要工作任務是：深化學校內部改革，激發事業發展動力；全面開展三風建設，營造良好育人環境；深化教育教學改革，提升學校內涵建設；切實加強隊伍建設，提高師資整體素質；推進后勤保障改革，努力提高服務水平；加強學生管理工作，維護校園和諧穩定；切實轉變工作方式，做好招生就業工作；加強實踐教學管理，提高實踐教學水平；積極申報新增專業，優化專業建設結構；認真抓好常規管理工作，確保各項事業協調發展。
目前，學校以黨的十八大精神為指導，深入實施《楚雄醫藥高等專科學校“十二五”發展規劃》，努力把楚雄醫藥高等專科學校建設成為云南省特色骨干示范院校。