開設浙江省遠洋漁業培訓中心、中國石化銷售公司舟山培訓中心等培訓組織，學校入選國家漁政局首批海洋漁業船員一級培訓機構。歷史上曾獲國家科技進步一等獎和三等獎各1項、二等獎2項，全國科學大會獎6項；提出了東海伏季休漁的建議案并被國家采用。年來主持了一批國家863計劃、國家科技支撐計劃、國家現代農業專項、國家重大國際科技合作計劃和國家自然科學、社會科學基金項目，年度科研經費達到8000萬元；主持完成了我國唯一的海域基準價核定標準《浙江省海域基準價核定規程》、我國首部海域使用權價值評估地方標準《浙江省海域評估規范》和世界首個石首魚科魚類--大黃魚全基因組序列圖譜；授權專利1200余項，其中發明專利200余項；獲國家科技進步二等獎（排名3）、中國商業聯合會科學技術獎特等獎、教育部科學研究優秀成果獎一等獎、省科技進步一等獎、國家海洋創新成果獎一等獎和中國專利優秀獎等省部級及以上獎勵40余項。與浙江沿海企業單位、政府部門以及國內外大院名校組建了40余個科技創新服務載體，連續參與中國海洋文化節相關活動，主辦中國海洋文化論壇、國際海洋科技論壇等各種學術會議，為區域海洋經濟社會發展做出了重要貢獻。
學校堅持實施“人才強校”戰略，大力加強師資隊伍建設。現有教職工1300余人，其中專任教師850余人，博士150余人，教授110余人。百名教師入選省新世紀151人才、高校中青年學科帶頭人、錢江人才等培養資助計劃，擁有國家“”獲得者、國家“杰出青年基金”獲得者、省“”獲得者、錢江學者等一批高層次人才，設有一批省級科技創新團隊、教學團隊和教學名師。物理海洋和環境海洋學家、中國科學院院士馮士筰為學校名譽院長；聘請地質學家、中國科學院院士殷鴻福等專家在校設立“院士專家工作站”；海洋腐蝕與防護學家、中國工程院院士侯保榮，海洋遙感專家、中國工程院院士潘德爐，生物海洋學家、中國科學院院士焦念志，軍事醫學與藥物化學專家、中國工程院院士陳冀勝，香料和食品添加劑專家、中國工程院院士孫寶國等受聘為學校客座教授。
學校堅持走國際化、開放式的辦學道路，積極開展對外交流與合作。建有國家科技部海洋領域國際科技合作基地和國家外國專家局中國海洋科技創新引智園區（共建），具有外國留學生、港澳臺學生招生權。與美國、加拿大、日本、俄羅斯、白俄羅斯、挪威等國（境）外40多所高校和科研機構建立了緊密的合作關系，與俄羅斯圣彼得堡海洋技術大學聯合舉辦了船舶與海洋工程專業，與日本東京海洋大學等一批高校開展了學生互換交流，與挪威生命科學大學等若干高校開展了聯合培養博士研究生項目，每年均選派一定數量的優秀學生赴國（境）外相關高校攻讀碩士、博士學位。
21世紀是海洋世紀，開發海洋，科教先行。國務院批復的《浙江海洋經濟發展示范區規劃》和《浙江舟山群島新區發展規劃》等明確提出，要在舟山“建設國家級海洋科教基地”，“努力把浙江海洋學院發展為海洋類大學”。當前，學校正借勢“海洋強國”戰略實施和浙江海洋經濟發展示范區、浙江舟山群島新區建設機遇，堅持立足新區、面向海洋、走向世界，堅持內涵發展、協同創新和國際化辦學，進一步優化結構、凝煉、強化優勢、提高質量。爭取到2020年，建成鮮明并在國內外具有影響的高水綜合性海洋大學，成為我國重要的海洋人才培養基地，海洋科技研發臺，海洋高新技術孵化園區，海洋科技引智載體和海洋人文社科研究中心。

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