溫州醫科大學的專業有：眼視光醫學、口腔醫學、臨床醫學、兒科學、中醫學、麻醉學、預防醫學、醫學技術類、精神醫學等。

溫州醫科大學專業名單

眼視光醫學（5+3一體化）（三位一體）

臨床醫學（5+3一體化）（三位一體）

臨床醫學（5+3一體化，兒科學方向）（三位一體）

臨床醫學（三位一體）

生物技術（三位一體）

信息管理與信息系統（三位一體）

公共管理類（三位一體）

臨床醫學（定向培養）

眼視光醫學（5+3一體化）

臨床醫學（5+3一體化）

臨床醫學（5+3一體化，兒科學方向）

臨床醫學（5+3一體化，精神方向）

眼視光醫學

口腔醫學

臨床醫學

兒科學

中醫學

麻醉學

預防醫學

醫學技術類

精神醫學

醫學影像學

臨床藥學

應用心理學

藥學類

康復治療學

生物醫學工程

生物技術

信息管理與信息系統

公共管理類

護理學

助產學

眼視光技術（專科）

護理（專科）

護理（專科，面向中職招生）